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年末調整で見落としがちな 10 の控除

年末調整は会社経由で完結する便利な仕組みですが、申告漏れで 数万円〜十数万円の還付を取り逃がす人が多数。よくある見落とし 10 個と、漏れた場合の対処法を整理します。

最終更新 2026-05-20解説 / 年末調整5分で読めます

見落としがちな 10 の控除

  1. 生命保険料控除 — 一般 + 介護医療 + 個人年金で最大 12 万円控除。証明書貼り忘れに注意
  2. 地震保険料控除 — 最大 5 万円。火災保険とのセット契約でも対象
  3. iDeCo (小規模企業共済等掛金控除) — 全額所得控除。掛金払込証明書 (10〜11 月送付) が必要
  4. 配偶者控除・配偶者特別控除 — 配偶者の年収が 103〜201 万なら段階的控除。年末に配偶者の年収を確認
  5. 扶養控除 — 16 歳以上で同居・別居の扶養家族。子の就職で扶養から外れる確認
  6. ひとり親控除・寡婦控除 — 配偶者と死別/離婚 + 扶養家族あり。所得税 35 万・住民税 30 万控除
  7. 障害者控除 — 本人・配偶者・扶養親族のいずれかが障害者なら最大 75 万控除
  8. 勤労学生控除 — 学生で年収 130 万以下なら 27 万円
  9. 住宅ローン控除 (2 年目以降) — 1 年目は確定申告必要。2 年目から年末調整可
  10. 社会保険料控除 — 自分で払った国民年金・国民健康保険、家族の国民年金もここに含める

配偶者控除の落とし穴

配偶者の年収区分控除額
〜103 万配偶者控除38 万
103〜150 万配偶者特別控除38 万 (満額)
150〜201 万配偶者特別控除38〜0 万 (段階)
201 万超対象外0

※ 11 月の年末調整時点で配偶者の年収見込みを記入するが、12 月の収入次第で実額がズレる場合は来年の確定申告で修正可能。

漏れに気づいたら還付申告 (5 年遡及)

  • 期限: 翌年 1/1 〜 5 年後の 12/31 (確定申告期間に縛られない)
  • 方法: e-Tax (マイナポータル) or 紙の申告書
  • 必要書類: 源泉徴収票・控除証明書・本人確認書類
  • 還付スピード: e-Tax 約 3 週間 / 紙 1〜2 ヶ月
  • 例: 5 年前の生命保険料控除漏れ (月 1 万 × 12 = 年 12 万 控除漏れ) → 所得税 5% で年 6,000 円・5 年で 3 万円還付

年末調整で完結しない控除 (要確定申告)

  • 医療費控除 (年 10 万円超 or セルフメディケーション 1.2 万円超)
  • 寄付金控除 (ふるさと納税のワンストップ未利用)
  • 住宅ローン控除 1 年目
  • 雑損控除 (災害・盗難)
  • 外国税額控除 (米国株配当等)
  • 株式譲渡損失の繰越

よくある質問

Q. 年末調整で何が漏れがち?
(1) 生命保険料控除証明書の貼り忘れ (2) iDeCo の小規模企業共済等掛金控除 (3) 配偶者の年収変動の反映 (4) 扶養親族の異動 (出生・就職・別居) (5) ひとり親・寡婦控除の申告漏れ。
Q. 申告漏れに後で気づいたら?
翌年 1/1〜5 年後の 12/31 まで「還付申告」できる。e-Tax で簡単に可。源泉徴収票・控除証明書を添えて提出すれば差額が戻る。
Q. 年末調整で完結しない控除は?
(1) 医療費控除 (2) 寄付金控除 (ふるさと納税ワンストップ未利用分) (3) 住宅ローン控除 1 年目 (4) 雑損控除 — これらは確定申告必須。

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